MUNA befindet sich in Calle Fuente Morales s/n, 38003 Santa Cruz de Tenerife, direkt im historischen Stadtkern, in der Nähe der Plaza de España.
Mit dem Auto: Das Museum befindet sich im Stadtzentrum von Santa Cruz, und es wird offiziell empfohlen, an der Plaza de España, am Mercado de Nuestra Señora de África oder entlang der Calle Ramón y Cajal zu parken – alle diese Orte sind nur einen kurzen Fußweg entfernt. Vom Flughafen Teneriffa Nord (Los Rodeos) aus ist die Fahrt nach Santa Cruz kurz, etwa 14 Kilometer und je nach Verkehrslage etwa 10 bis 15 Minuten. Vom Flughafen Teneriffa-Süd (Reina Sofía) aus ist die Fahrt über die Autobahn TF-1 länger, in der Regel etwa 60 bis 65 Kilometer und 40 bis 45 Minuten.
Mit öffentlichen Verkehrsmitteln: Die Linie 1 der Tranvía de Tenerife hält an der Haltestelle "Fundación", nur wenige Gehminuten vom Museum entfernt, sodass die Straßenbahn eine der bequemsten Möglichkeiten ist, das MUNA von anderen Orten in Santa Cruz oder dem nahegelegenen La Laguna aus zu erreichen. Auch die TITSA-Busse bedienen das Gebiet umfassend und bieten Verbindungen von beiden Flughäfen zum Verkehrsknotenpunkt 'Intercambiador“ (Meridiano) im Zentrum von Santa Cruz, von wo aus das Museum nach einem kurzen Fußweg oder einer kurzen Fahrt mit der Straßenbahn oder dem Taxi zu erreichen ist. Vom Flughafen Teneriffa-Nord dauert die Busfahrt ins Zentrum etwa 15 Minuten; vom Flughafen Teneriffa-Süd sollten Sie eher eine Stunde einplanen, da die Strecke länger ist.
Mit dem Taxi oder einer Mitfahrgelegenheit: An beiden Flughäfen, am Kreuzfahrthafen und in ganz Santa Cruz stehen Taxis zur Verfügung. Eine Taxifahrt vom Flughafen Teneriffa-Nord zum MUNA dauert etwa 10 bis 15 Minuten, während die Fahrt vom Flughafen Teneriffa-Süd aufgrund der Entfernung eher 40 Minuten in Anspruch nimmt.
Zu Fuß: Da sich das MUNA mitten im historischen Zentrum befindet, ist es von den meisten Hotels im Zentrum von Santa Cruz, der Uferpromenade an der Plaza de España und benachbarten Kulturstätten wie dem TEA bequem zu Fuß zu erreichen – in der Regel innerhalb von 10 bis 15 Minuten.